試行錯誤の末、何とかマルチサイト化に成功した。発生していた問題はまたもや初歩的な問題だった。loginできなかったのはブラウザのセッションの問題だった。タブを閉じたりブラウザを終了することで解決した。
難問と思われたIntarnal Server Errorはサーバーの問題は.htaccess の中身の問題でなくなんと.htaccessの文字コードの問題だったようだ。.htaccessが原因かもしれないと思い、.htaccessをーから勉強してみたがほとんどわからない。途方にくれて検索してみるとヒット！！「BOM付のUTF-8ではダメ」だとか。現有知識の枠を越えた全く理解不能の理由だった。危うく迷宮入りするか、下手に他の設定をいじり倒して大混乱に陥るところだったが今回もgoogle検索に救われた。